—旦确诊，即应积极治疗，鉴于瑞特综合征的发病与感染有关，应抗炎与对症综合治疗。
　　急性期为清除肠道或泌尿道细菌应该使用抗生素，抗生素的选择应依据发病类型、细菌种类而定。一般认为性病型首选四环素或红霉素，疗程应在10～14天；而肠病型最好根据肠道菌培养结果选择敏感性药物。抗生素的应用对于瑞特综合征的病程和预后有一定的帮助。对于已婚性病型瑞特综合征病人的妻子或丈夫，最好也应给予一个疗程的抗生素治疗，以防反复交叉感染。
　　针对病人关节及附着点病变所引起的肿痛，可选用非甾体类抗炎药，这类药品种较多，如可用扶他林25～50毫克口服，每日3次；消炎痛25～50毫克口服，每日2～3次；萘普生0.375克，每日2次等。保太松虽止痛疗效较好，但因副作用较大应避免使用。对症状较重的病例在应用非甾体炎抗炎药治疗的同时，应积极使用慢作用药，如柳氮磺胺吡啶、氨甲喋呤等。此类药被认为有缓解病程，维持疾病稳定和避免复发的作用。具体选择使用宜在医生的指导下进行。
　　结膜炎和皮肤粘膜的病变通常不需要治疗，但必须保持局部卫生避免细菌感染。
　　此外，对急性发热期关节肿痛明显的病人，应卧床休息，加强营养，补充维生素及摄入足够的水分。待情况恢复正常，关节肿痛减轻时，应逐渐增加关节的活动范围以避免受累关节变形及邻近肌肉萎缩。